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新疆大学新疆大学位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐，是新疆办学规模较大、办学历史较为悠久、学科门类较为齐全、科研水平较高的综合性大学。新大现有校本部、南校区、北校区三个校区，校内教学、生活、活动等现代化设施一应俱全；设有26个学院、1个研究生院、2个教学研究部、36个党政机关及教辅单位，开办95个本科专业，涵盖了经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、管理学、艺术学、哲学九个学科门类。
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石河子大学石河子大学是国家“211工程”重点建设高校、国家“双一流”建设一流学科建设高校、国家西部重点建设高校和省部共建高校，是“中西部高校基础能力建设工程”和“中西部高校综合实力提升工程”（一省一校）入选高校。学校先后荣获“全国普通高校毕业生就业工作先进集体”、“全国毕业生就业典型经验50所高校”等荣誉称号。
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新疆农业大学新疆农业大学位于乌鲁木齐市，是自治区重点建设的一所农业高等院校，前身为新疆八一农学院，是经毛主席和中央军委同意，由王震将军于1952年创建，是新中国成立后新疆建立的第一所本科院校。学校入选中西部高校基础能力建设工程、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家“特色重点学科项目”、国家首批“卓越农林人才教育培养计划”改革试点高校、教育部“卓越工程师教育培养计划”高校、国家大学生文化素质教育基地，丝绸之路沿线国家农业院校联盟发起成员。
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新疆师范大学新疆师范大学成立于1978年12月28日，其前身为1906年成立的乌鲁木齐市第一师范学校和1972年成立的新疆教师培训部。学校位于新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，是“中西部高校基础能力建设工程高校”之一，为上海合作组织大学、国家大学生文化素质教育基地、首批教育部来华留学示范基地建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校，由华东师范大学和吉林大学等内地高校共同承担对口支援新疆师范大学。
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新疆医科大学新疆医科大学创办于1956年，是新疆一所省部委共建的医学高等学府。新疆医科大学现有雪莲山校区、新医路校区、鲤鱼山校区、明园校区、仓房沟校区5个校区，校园教学设施基本完善；设有25个院部、28个本科专业、10个专科专业，拥有10个一级学科硕士学位授权点、8个硕士专业学位授权点、4个博士后科研流动站、4个博士后科研工作站，涵盖医学、管理学、理学、文学四个学科门类。
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塔里木大学塔里木大学位于新疆维吾尔自治区阿拉尔市，创办于1958年，是国务院学位委员会批准的首批具有学士学位授予权的本科院校，是一所以农为优势，以生命科学为特色，农、理、工、文、管、法、经、教育、艺术、历史等多学科协调发展的综合性大学。塔里木大学现有11个学院，58个本科专业，培养输送了近7万名毕业生，就业率连续10年排在自治区高校前列；毕业生为新疆特别是南疆经济发展、社会进步、民族团结、维稳戍边等作出了突出贡献。
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新疆财经大学新疆财经大学前身是1950年成立的新疆省人民政府干部学校，是新疆一所财经类高等学府，也是新疆维吾尔自治区重点建设的五所高校之一。学校与中国人民大学、中央财经大学、西安交通大学等高校建立了对口支援关系；与美国威斯康辛协和大学、韩国又松大学、俄罗斯新西伯利亚经济管理大学等40余所国外大学建立了合作关系，并与哈萨克斯坦阿克托别州朱巴诺夫国立大学合作建立了孔子学院。
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伊犁师范大学伊犁师范大学前身是1948年成立的新疆省立伊犁专科学校，是一所隶属新疆维吾尔自治区管理的普通高等师范学校，为教育部、新疆维吾尔自治区、江苏省共建院校。学校坚持党管教育根本原则，坚持社会主义办学方向，秉承“品正学实”的校训，发扬爱国、崇德、勤奋、求实的光荣传统，努力建设成为办学特色鲜明，重点学科领先，教师教育优势突出，服务社会能力强劲，区内先进、国内有重要影响的高水平师范大学。
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喀什大学喀什大学位于位于新疆维吾尔自治区喀什市，始建于1962年，是中西部高校基础能力建设工程高校，为全国100所转型发展试点高校之一。喀什大学现有16个教学单位，55个本科专业，涵盖理学、工学、文学、教育学、艺术学、法学、经济学、管理学、历史学九个学科门类，培养了10万余名具有良好思想品德修养和扎实专业技能的基础教育师资和各类专门人才。学校先后被授予“全国民族团结进步模范集体”、“全国民族团结进步模范集体”等光荣称号。
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昌吉学院昌吉学院坐落在新疆维吾尔自治区昌吉市，是区属普通高等学校。学校前身是成立于1959年的昌吉师范学校，2001年5月升格为昌吉学院。学校与山东大学、陕西师范大学、吉林大学、厦门大学、北京林业大学、兰州大学、中国石油大学（华东）建立了长期对口支援关系，并与山东大学、陕西师范大学、厦门大学联合培养本科生及研究生。