模拟投档与正式投档的区别是，模拟投档线是在模拟过程中形成的，模拟投档线每模拟一次都不一样，是录取工作中不确定的分数线。而正式投档线是唯一确定的院校实际调档最低分，即正式投档线，进行模拟投档的目的就是为了确定合适的正式投档线，一般最后一次模拟投档就是正式投档。
为什么要进行模拟投档
因为高考人数众多，考生填报的志愿也很多，为了确保准确性，以及考虑到某些院校报考人数过多或过少情况，则需要和各院校沟通招生计划。
第一次模拟投档，考试院可以看出哪些学校报的人多，哪些学校报的人少，特别是报的人多的高校，考试院甚至还会和高校进行沟通，高校根据实际情况做出是否追加录取名额等。待院校调整招生计划后，会再次进行二次三次模拟投档，直至这个投档结果看起来没有很大问题，以及基本达到各院校招生计划投档要求后，就进行正式投档。
模拟投档和正式投档发生在各省考试院和招生院校之间，正式档案投出前，院校看不到考生信息。经过多轮模拟投档和信息交互，各个院校的投档条件得到确定，最终招生计划数不再变化后就进入了正式投档阶段。