山西医科大学是一本还是二本院校要根据生源地录取批次来决定。山西医科大学在北京、河北、辽宁、上海、江苏、福建、湖北、湖南、广东、海南的录取批次是本科批次，所以山西医科大学在这些省市是本科院校。山西医科大学在内蒙古、安徽、江西、河南、广西、贵州、云南的录取批次是本科第一批次，所以山西医科大学在这些省市是一本大学。在西藏、陕西、新疆的录取批次是本科第二批次，所以山西医科大学在这省市是二本大学。
材料补充：
山西医科大学前身是山西医学传习所，创建于1919年8月。1921年8月，改为山西医学专门学校，1928年8月，更名为山西医学专科学校。1932年1月，组建为私立山西川至医学专科学校，1940年3月并入山西大学，称作山西大学医学专修科。1946年8月，升格为国立山西大学医学院。1953年9月，独立建校，更名为山西医学院，1996年9月，更名为山西医科大学。山西医科大学是全国第三批、山西省首批博士学位授权单位，也是全国首批硕士学位授权单位，有川至、迎泽、中都三个校区。